10        20        30        40        50        60
| | | | | |
bosxxx0 ---MAALLLRHVGRHCLRAHLSPQLCIRNAVPLGTTAKEEMERFWSKNTTLNRPLSPHIS
susxxx0 ---MAALLLRHVGRHCLRAHLSPQLCIRNAVPLGTTAKEEMERFWNKNLGSNRPLSPHIT
Homoxx1 ---MAALLLRHVGRHCLRAHFSPQLCIRNAVPLGTTAKEEMERFWNKNIGSNRPLSPHIT
Gallus ---MAALVLRCVARRCLLARLSPGPSVHHVVPMATTAKEEMARFWEKNTKSSRPLSPHIS  
S.c.msammvklglnksalllkpsafsraaalsssrrllfntartnflstsplknvasemntkaaiaeeqilnkqrakrpisphlt
Rickettsiaprowazekii -----------------------------------------MTKIKQEIYNKRPTSPHLT
Paracoccusdenitrificans --------------------------------------
------MADVNRGNRPLSPHLQ
Chondruscrispus ------------------------------------
-------MFIKFKISNRPIAPHLL
Porphyrapurpurea -----------------------------------------
------MYNINRPISPHLT
Marchantiapolymorpha --------------------------------------
----------MKINRPLSPHLT
Reclinomonasamericana --------------------------
------MISINFNFLKIKGIINMNINRPISPHLT
EcoliSDH13991_DEECS4 -------------------------------------
-------MIRNVKKQRPVNLDLQ
Caenorhabditisbriggsae MINIPTSILCRLGARSAISRSFGTSVVTKSEAKTPIQKFGWEYLKKQR-DMKRPIAPHLT
EcoliFRD12 -----------------------------------------MTTKRK-----PYVRPMTS

Prim.cons. MINMAALLLRHVGRHCLRAH3SPQLCIRN2VPLGTTAK23ME2FKIKN233NRP2SPHLT



 
70 80 90 100 110 120
| | Hd| | | |
bosxxx0 IYGWSLPMAMSICHRGTGIALSAGVSLFGLSALLVPGSFESHLEFVKSLCLG-----PAL
susxxx0
IYRWSLPMAMSICHRGTGIALSAGVSLFGLSALLLPGNFESHLELVKSLCLG-----PTL
Homoxx1 IYSWSLPMAMSICHRGTGIALSAGVSLFGMSALLLPGNFESYLELVKSLCLG-----PAL
Gallus IYKWSLPMAMSITHRGTGVALSLGVSLFSLAALLLPEQFPHYVAVVKSLSLS-----PAL
S.cerevisiae iyqpqltwylsslhrislvlmglgfylftilfgvsgllglglttekvsnwyhqkfskit
Rickettsiaprowazekii IYKPQISSTLSILHRMTGVALFFVVSILVWWLILS--KYDNNYLQLASCCI---------
Paracoccusdenitrificans VYRLPLAAITSIMTRITGHALVAGIVLITWWLVAA--VTSPGAFACADWVVR-----SWL
Chondruscrispus VYTPQLSSLFSIWHRISGVGLAFFFTTFLIFIRII--LSSNFACNLLTLIS--FEISQWI
Porphyrapurpurea IYNTQKSSLFSIWHRISGVAMFTLIASPPLFLKLA--TFSYKSFNILDLM---LNNSSLI
Marchantiapolymorpha IYKPQLTSTFSIFHRISGAFLATMVLFSILFFKIG--DLSLTFYHFYQYFFFLTFYLNWF
Reclinomonasamericana IYKLQITNTLSIFHRITGGVLALTLCFFILILKML--NFHLSSYAFYSIAYTLNQYSGFL
EcoliSDH13991_DEECS4 TIRFPITAIASILHRVSGVITFVAVGILLWLLGTS--LSSPEGFEQASAIMG-----SFF
Caenorhabditisbriggsae IYQPQLTWMLSGFHRISGCVMAGTLLVGGLGFAVLPLDFTTFVEYIRGWNLP-----CAV
EcoliFRD12 TWWKKLPFYRFYMLREGTAVPAVWFSIELIFGLFALKNGPEAWAGFVDFLQN------PV
. * .
Prim.cons. IYKPQLTST2SIFHRI2GVALAAGVS2F2LFL2L2PGNFS4F322FASLCLGL44YSS2L


130 140 150 160 170 180
| Hp | | | | |
bosxxx0 IHTAKFALVFPLMYHTWNGIRHLMWDLGKGLTISQLHQ-----SGVAVLVLTVLSSVGLA
susxxx0
IYTAKFGIVFPLMYHTWNGIRHLIWDLGKGLTIPQLTQ SGVVVLILTVLSSVGLA
Homoxx1 IHTAKFALVFPLMYHTWNGIRHLMWDLGKGLKIPQLYQ-----SGVVVLVLTVLSSMGLA
Gallus IYSAKFALVFPLSYHTWNGIRHLVWDMGKGFKLSQVEQ-----SGVVVLILTLLSSAGIA
S.cerevisiae ewsikgsfaylfaihyggairhliwdtakeltlkgvyr-----tgyaligftavlgtyll
Rickettsiaprowazekii IKICLVAFSYSWCYHLCNGIRHLFWDIGYGFSIKAVNI-----TGWCVVVCSILLTMLLW
Paracoccusdenitrificans GFIILTGSMWALWYHLLAGLRHLFYDAGYGLEIEQAHK-----SSQALIAGSVVLAVLTL
Chondruscrispus IIYFNLFILLFLFYHLFNGTRHIIWDFGFLLDIKYLSK-----FSLFLLVSLSLILIFQ-
Porphyrapurpurea LPWFIVIISVIFLYHIINGIRHFLWDSVVNVNTESIIK-----DSNTLLALVFLIMLFKF
Marchantiapolymorpha IISLVNFTLLALCYHMSNGVRHLLWDLGFFLELSKVYT-----SGIIMLFCAAFLALLNI
Reclinomonasamericana FIAISFFLLLFIFYHLFAGLRHLVWDAGYALEIENVYL-----TGYIMLGLAFLFTLIAW
EcoliSDH13991_DEECS4 VKFIMWGILTALAYHVVVGIRHMMMDFGYLEETFEAGKR----SAKISFVITVVLSLLAG
Caenorhabditisbriggsae TAVFKYIIAFPIIFHTLNGIRFLGFDLAKGVDNIGQVYK----SGWLVFGVSAVIALAIV
EcoliFRD12 IVIINLITLAAALLHTKTWFELAPKAANIIVKDEKMGPEPIIKSLWAVTVVATIVILFVA
* . . :
Prim.cons. IIIIKF3IL2AL4YH23NGIRHLMWDLGYGLEIEQ2YK3PIIKSGW2VLVL3VLL2LLLA

181

190
|
bosxxx0 AM------------
Sus
AM------------
Homoxx1 AM------------
Gallus
AIS
S.cerevisiae TL
Rickettsiaprowazekii V-------------
Paracoccusdenitrificans IVFFVF--------
Chondruscrispus --------------
Porphyrapurpurea IL------------
Marchantiapolymorpha IRQHWSNGQIPY--
Reclinomonasamericana IIF-----------
EcoliSDH13991_DEECS4 VLVW----------
Caenorhabditisbriggsae INSCQNKSKAVKTA
EcoliFRD12 LYW-----------


1 Homo
2 1ZOY
3 bos-
4 gallus
5 Rickettsia_p
6 Paradeni
7 EcoliSDH
8 Caenorhabditis_b
9 EcoliFRD
man pig cow chik Rckts Pard EcoSDH Caen EcoFRD
1 -- -- -- -- -- -- -- M1 --
2 -- -- -- -- -- -- -- I2 --
3 -- -- -- -- -- -- -- N3 --
4 M1 -- M1 -- -- -- -- I4 --
5 A2 -- A2 -- -- -- -- P5 --
6 A3 -- A3 -- -- -- -- T6 --
7 L4 -- L4 -- -- -- -- S7 --
8 L5 -- L5 -- -- -- -- I8 --
9 L6 -- L6 -- -- -- -- L9 --
10 R7 -- R7 -- -- -- -- C10 --
11 H8 -- H8 -- -- -- -- R11 --
12 V9 -- V9 -- -- -- -- L12 --
13 G10 -- G10 -- -- -- -- G13 --
14 R11 -- R11 -- -- -- -- A14 --
15 H12 -- H12 -- -- -- -- R15 --
16 C13 -- C13 -- -- -- -- S16 --
17 L14 -- L14 -- -- -- -- A17 --
18 R15 -- R15 -- -- -- -- I18 --
19 A16 -- A16 -- -- -- -- S19 --
20 H17 -- H17 -- -- -- -- R20 --
21 F18 -- L18 -- -- -- -- S21 --
22 S19 -- S19 -- -- -- -- F22 --
23 P20 -- P20 -- -- -- -- G23 --
24 Q21 -- Q21 -- -- -- -- T24 --
25 L22 -- L22 -- -- -- -- S25 --
26 C23 -- C23 -- -- -- -- V26 --
27 I24 -- I24 -- -- -- -- V27 --
28 R25 -- R25 -- -- -- -- T28 --
29 N26 -- N26 -- -- -- -- K29 --
30 A27 -- A27 -- -- -- -- S30 --
31 V28 -- V28 -- -- -- -- E31 --
32 P29 -- P29 -- -- -- -- A32 --
33 L30 L1 L30 M1 -- -- -- K33 --
34 G31 G2 G31 A2 -- -- -- T34 --
35 T32 T3 T32 T3 -- -- -- P35 --
36 T33 T4 T33 T4 -- -- -- I36 --
37 A34 A5 A34 A5 M1 -- -- Q37 --
38 K35 K6 K35 K6 T2 -- -- K38 --
39 E36 E7 E36 E7 K3 -- -- F39 --
40 E37 E8 E37 E8 I4 -- M1 G40 --
41 M38 M9 M38 M9 K5 M1 I2 W41 --
42 E39 E10 E39 A10 Q6 A2 R3 E42 M1
43 R40 R11 R40 R11 E7 D3 N4 Y43 T2
44 F41 F12 F41 F12 I8 V4 V5 L44 T3
45 W42 W13 W42 W13 Y9 N5 K6 K45 K4
46 N43 N14 S43 E14 N10 R6 K7 K46 R5
47 K44 K15 K44 K15 K11 G7 Q8 Q47 K6
48 N45 N16 N45 N16 -- N8 -- R48 --
49 I46 L17 T46 T17 -- -- -- -- --
50 G47 G18 T47 K18 -- -- -- D49 --
51 S48 S19 L48 S19 -- -- -- M50 --
52 N49 N20 N49 S20 -- -- -- K51 --
53 R50 R21 R50 R21 R12 R9 R9 R52 P7
54 P51 P22 P51 P22 P13 P10 P10 P53 Y8
55 L52 L23 L52 L23 T14 L11 V11 I54 V9
56 S53 S24 S53 S24 S15 S12 N12 A55 R10
57 P54 P25 P54 P25 P16 P13 L13 P56 P11
58 H55 H26 H55 H26 H17 H14 D14 H57 M12
59 I56 I27 I56 I27 L18 L15 L15 L58 T13
60 T57 T28 S57 S28 T19 Q16 Q16 T59 S14
61 I58 I29 I58 I29 I20 V17 T17 I60 T15
62 Y59 Y30 Y59 Y30 Y21 Y18 I18 Y61 W16
63 S60 R31 G60 K31 K22 R19 R19 Q62 W17
64 W61 W32 W61 W32 P23 L20 F20 P63 K18
65 S62 S33 S62 S33 Q24 P21 P21 Q64 K19
66 L63 L34 L63 L34 I25 L22 I22 L65 L20
67 P64 P35 P64 P35 S26 A23 T23 T66 P21
68 M65 M36 M65 M36 S27 A24 A24 W67 F22
69 A66 A37 A66 A37 T28 I25 I25 M68 Y23
70 M67 M38 M67 M38 L29 T26 A26 L69 R24
71 S68 S39 S68 S39 S30 S27 S27 S70 F25 Mutated CAYu Q-site (lifand?)
72 I69 I40 I69 I40 I31 I28 I28 G71 Y26 mev-1 in C. elegans: gly->glu
73 C70 C41 C70 T41 L32 M29 L29 F72 M27
74 H71 H42 H71 H42 H33 T30 H30 H73 L28
75 R72 R43 R72 R43 R34 R31 R31 R74 R29 Mutated CAYu in Ecoli. Guanidino H-bonds D58, Heme propionate.
76 G73 G44 G73 G44 M35 I32 V32 I75 E30 (mutated in mouse by Ischii)
77 T74 T45 T74 T45 T36 T33 S33 S76 G31 Mutated CAYu heme-bracing
78 G75 G46 G75 G46 G37 G34 G34 G77 T32 close contact with heme ("notch")
79 I76 I47 I76 V47 V38 H35 V35 C78 A33
80 A77 A48 A77 A48 A39 A36 I36 V79 V34
81 L78 L49 L78 L49 L40 L37 T37 M80 P35
82 S79 S50 S79 S50 F41 V38 F38 A81 A36
83 A80 A51 A80 L51 F42 A39 V39 G82 V37
84 G81 G52 G81 G52 V43 G40 A40 T83 W38
85 V82 V53 V82 V53 V44 I41 V41 L84 F39
86 S83 S54 S83 S54 S45 V42 G42 L85 S40
87 L84 L55 L84 L55 I46 L43 I43 V86 I41
88 F85 F56 F85 F56 L47 I44 L44 G87 E42
89 G86 G57 G86 S57 V48 T45 L45 G88 L43
90 M87 L58 L87 L58 W49 W46 W46 L89 I44
91 S88 S59 S88 A59 W50 W47 L47 G90 F45
92 A89 A60 A89 A60 L51 L48 L48 F91 G46
93 L90 L61 L90 L61 I52 V49 G49 A92 L47
94 L91 L62 L91 L62 L53 A50 T50 V93 F48
95 L92 L63 V92 L63 S54 A51 S51 L94 A49
96 P93 P64 P93 P64 -- -- -- P95 L50
97 G94 G65 G94 E65 -- -- -- L96 K51
98 N95 N66 S95 Q66 K55 V52 L52 D97 N52
99 F96 F67 F96 F67 Y56 T53 S53 F98 G53
100 E97 E68 E97 P68 D57 S54 S54 T99 P54
101 S98 S69 S98 H69 N58 P55 P55 T100 E55
102 Y99 H70 H99 Y70 N59 G56 E56 F101 A56
103 L100 L71 L100 V71 Y60 A57 G57 V102 W57
104 E101 E72 E101 A72 L61 F58 F58 E103 A58
105 L102 L73 F102 V73 Q62 A59 E59 Y104 G59
106 V103 V74 V103 V74 L63 C60 Q60 I105 F60
107 K104 K75 K104 K75 A64 A61 A61 R106 V61
108 S105 S76 S105 S76 S65 D62 S62 G107 D62
109 L106 L77 L106 L77 C66 W63 A63 W108 F63
110 C107 C78 C107 S78 C67 V64 I64 N109 L64
111 L108 L79 L108 L79 I68 V65 M65 L110 Q65
112 G109 G80 G109 S80 -- R66 G66 P111 N66
113 -- -- -- -- -- -- -- -- --
114 -- -- -- -- -- -- -- -- --
115 -- -- -- -- -- -- -- -- --
116 -- -- -- -- -- -- -- -- --
117 -- -- -- -- -- -- -- -- --
118 P110 P81 P110 P81 -- S67 S67 C112 --
119 A111 T82 A111 A82 -- W68 F68 A113 P67
120 L112 L83 L112 L83 -- L69 F69 V114 V68
121 I113 I84 I113 I84 I69 G70 V70 T115 I69
122 H114 Y85 H114 Y85 K70 F71 K71 A116 V70
123 T115 T86 T115 S86 I71 I72 F72 V117 I71
124 A116 A87 A116 A87 C72 I73 I73 F118 I72
125 K117 K88 K117 K88 L73 L74 M74 K119 N73
126 F118 F89 F118 F89 V74 T75 W75 Y120 L74
127 A119 G90 A119 A90 A75 G76 G76 I121 I75
128 L120 I91 L120 L91 F76 S77 I77 I122 T76
129 V121 V92 V121 V92 S77 M78 L78 A123 L77
130 F122 F93 F122 F93 Y78 W79 T79 F124 A78
131 P123 P94 P123 P94 S79 A80 A80 P125 A79
132 L124 L95 L124 L95 W80 L81 L81 I126 A80
133 M125 M96 M125 S96 C81 W82 A82 I127 L81
134 Y126 Y97 Y126 Y97 Y82 Y83 Y83 F128 L82
135 H127 H98 H127 H98 H83 H84 H84 H129 H83 Heme ligand
136 T128 T99 T128 T99 L84 L85 V85 T130 T84
137 W129 W100 W129 W100 C85 L86 V86 L131 K85
138 N130 N101 N130 N101 N86 A87 V87 N132 T86
139 G131 G102 G131 G102 G87 G88 G88 G133 W87
140 I132 I103 I132 I103 I88 L89 I89 I134 F88
141 R133 R104 R133 R104 R89 R90 R90 R135 E89
142 H134 H105 H134 H105 H90 H91 H91 F136 L90
143 L135 L106 L135 L106 L91 L92 M92 L137 A91
144 M136 I107 M136 V107 F92 F93 M93 G138 P92
145 W137 W108 W137 W108 W93 Y94 M94 F139 K93
146 D138 D109 D138 D109 D94 D95 D95 D140 A94
147 L139 L110 L139 M110 I95 A96 F96 L141 A95
148 G140 G111 G140 G111 G96 G97 G97 A142 N96
149 K141 K112 K141 K112 Y97 Y98 Y98 K143 I97
150 G142 G113 G142 G113 G98 G99 L99 G144 I98
151 L143 L114 L143 F114 F99 L100 E100 V145 V99
152 K144 T115 T144 K115 S100 E101 E101 D146 K100
153 I145 I116 I145 L116 I101 I102 T102 N147 D101
154 P146 P117 S146 S117 K102 E103 F103 I148 E102
155 Q147 Q118 Q147 Q118 A103 Q104 E104 G149 K103
156 L148 L119 L148 V119 V104 A105 A105 Q150 M104
157 Y149 T120 H149 E120 N105 H106 G106 V151 G105
158 Q150 Q121 Q150 Q121 I106 K107 K107 Y152 P106
159 -- -- -- -- -- -- R108 K153 E107
160 -- -- -- -- -- -- -- -- P108
161 -- -- -- -- -- -- -- -- --
162 -- -- -- -- -- -- -- -- I109
163 -- -- -- -- -- -- -- -- I110
164 -- -- -- -- -- -- -- -- K111
165 S151 S122 S151 S122 T107 S108 S109 S154 S112
166 G152 G123 G152 G123 G108 S109 A110 G155 L113
167 V153 V124 V153 V124 W109 Q110 K111 W156 W114
168 V154 V125 A154 V125 C110 A111 I112 L157 A115
169 V155 V126 V155 V126 V111 L112 S113 V158 V116
170 L156 L127 L156 L127 V112 I113 F114 F159 T117
171 V157 I128 V157 I128 V113 A114 V115 G160 V118
172 L158 L129 L158 L129 C114 G115 I116 V161 V119
173 T159 T130 T159 T130 S115 S116 T117 S162 A120
174 V160 V131 V160 L131 I116 V117 V118 A163 T121
175 L161 L132 L161 L132 L117 V118 V119 V164 I122
176 S162 S133 S162 S133 L118 L119 L120 I165 V123
177 S163 S134 S163 S134 T119 A120 S121 A166 I124
178 M164 V135 V164 A135 M120 V121 L122 L167 L125
179 G165 G136 G165 G136 L121 L122 L123 A168 F126
180 L166 L137 L166 I137 L122 T123 A124 I169 V127
181 A167 A138 A167 A138 W123 L124 G125 V170 A128
182 A168 A139 A168 A139 V124 I125 V126 I171 L129
183 M169 M140 M169 I140 -- V126 L127 N172 Y130
184 -- -- -- S141 -- F127 V128 S173 W131
185 -- -- -- -- -- F128 W129 C174 --
186 -- -- -- -- -- V129 -- Q175 --
187 -- -- -- -- -- F130 -- N176 --
188 -- -- -- -- -- -- -- K177 --
189 -- -- -- -- -- -- -- S178 --
190 -- -- -- -- -- -- -- K179 --
191 -- -- -- -- -- -- -- A180 --
192 -- -- -- -- -- -- -- V181 --
193 -- -- -- -- -- -- -- K182 --
194 -- -- -- -- -- -- -- T183 --
195 -- -- -- -- -- -- -- A184 --
196 170 141 170 142 125 131 130 185 132