0 10 20 30 40 | | | | | | Chlamy.rein -------------SSRRVAAPAKASAIRRSRVMPVVRAAAASSEVPDMNKRNIMNLILAGGAGLP Spinacia.o SSKNGMFAPSLALAKAGRVNVLISKERIRGMKLTCQATSIPADNVPDMQKRETLNLLLLGALSLP Mastigo.lamin -----------------------------------MAQFTESMDVPDMGRRQFMNLLAFGTVTGV Synecho.sp -----------------------------------MTQISGSPDVPDLGRRQFMNLLTFGTITGV Bostaurus ------------------SHTDIKVPDFSDYRRPEVLDSTKSSKESSEARKGFSYLVTATTTVGV Chicken ------------------VHNDVTVPDFSAYRREDVMDATTSSQTSSEDRKGFSYLVTATACVAT Sachcere -------------------KSTYRTPNFDDVLK---------ENNDADKGRSYAYFMVGAMGLLS Rbsphaer ---------------------------------------MSNAEDHAGTRRDFLYYATAGAGAVA Rbcapsul ---------------------------------------MSHAEDNAGTRRDFLYHATAATGVVV HHHHHHHHHHHHHHHHHH
Chlamy.rein
---
-
----
SSRRVAAPAKASAIRRSRVMPVVRAAAASSEVPDMNKRNIMNLILAG
GAGLP
Spinacia.o
SSKNGMFAPSLALAKAGRVNVLISKERIRGMKLTCQATSIPADNVPDMQKRETLNLLLLG
ALSLP
Mastigo.lamin
----------------------------
-----
--MAQFTESMDVPDMGRRQFMNLLAFG
TVTGV
Synecho.sp
--------------------------
----MTQISGSPDVPDLGRRQFMNLLTFG
TITGV
-------------
50 60 70 80 90 100 110 | | | | | | | Chlamy.rein ITTLALGYGAFFVPPSSGGGGGGQAAKDALGNDIKAGEWLKTHLAGDRSLSQGLKGDPTYLIVTA-------- Spinacia.o TGYMLLPYASFFVPPGGGAGTGGTIAKDALGNDVIAAEWLKTHAPGDRTLTQGLKGDPTYLVVES-------- Mastigo.lamin ALGALYPLVKYFIPPSGGAVGGGTTAKDKLGNNVKVSKFLESHNAGDRVLVQGLKGDPTYIVVES-------- Synecho.sp AAGALYPAVKYLIPPSSGGSGGGVTAKDALGNDVKVTEFLASHNAGDRVLAQGLKGDPTYIVVQG-------- Bostaurus AYAAKNVVSQFVSSMSASADV-LAMSKIEIKL--------SDIPEGKNMAFKW-RGKPLFVRHRTKKEIDQEA Chicken AYAAKNVVTQFISSLSASADV-LALSKIEIKL--------SDIPEGKNVAFKW-RGKPLFVRHRTQAEINQEA Sachcere SAGAKSTVETFISSMTATADV-LAMAKVEVNL--------AAIPLGKNVVVKW-QGKPVFIRHRTPHEIQEAN Rbsphaer TGAA---VWPLINQMNPSADV-QALASIFVDV--------SSVEPGVQLTVKF-LGKPIFIRRRTEADIELGR Rbcapsul TGAA---VWPLINQMNASADV-KAMASIFVDV--------SAVEVGTQLTVKW-RGKPVFIRRRDEKDIELAR HHH-TMH-HHH HHHH - --b1- --b2--- ---b3--- -HELIX--
50 60 70 80 90 100
110
| | |
|
Chlamy.rein ITTLALGYGAFFVPPSSGGGGGGQAAKDALGNDIKAGEWLKTHLAGDRSLSQG
LKGDPTYLIVTA--------
TGYMLLPYASFFVPPGGGAGTGGTIAKDALGNDVIAAEWLKTHAPGDRTLTQG
LKGDPTYLVVES
--------
ALGALYPLVKYFIPPSGGAVGGGTTAKDKLGNNVKVSKFLESHNAGDRVLVQG
LKGDPTYIVVES--------
AAGALYPAVKYLIPPSSGGSGGGVTAKDALGNDVKVTEFLASHNAGDRVLAQG
LKGDPTYIVVQG--------
120 130 140 150 160 | | | | | Chlamy.rein -----------------------------------DSTIEKYGLNAVCTHLGCVVPWV-AAENK-FKCPCHGSpinacia.o -----------------------------------DKTLATFGINAVCTHLGCVVPFN-AAENK-FICPCHGMastigo.lamin -----------------------------------KEAIRDYGINAVCTHLGCVVPWN-AAENK-FKCPCHGSynecho.sp -----------------------------------DDTIANYGINAVCTHLGCVVPWN-ASENK-FMCPCHGBostaurus AVEVSQLRDP------------QHDLERVK-------KPEWVILIGVCTHLGCVPIAN-AGDFGGYYCPCHG Chicken EVDVSKLRDP------------QHDLDRVK-------KPEWVILVGVCTHLGCVPIAN-SGDFGGYYCPCHG Sachcere SVDMSALKDP------------QTDADRVK-------DPQWLIMLGICTHLGCVPIGE-AGDFGGWFCPCHG Rbsphaer SVQLGQLVDTNARNANIDAGAEATDQNRTLD-----EAGEWLVMWGVCTHLGCVPIGGVSGDFGGWFCPCHG Rbcapsul SVPLGALRDTSAENANK-PGAEATDENRTLPAFDGTNTGEWLVMLGVCTHLGCVPMGDKSGDFGGWFCPCHG -HELIX- turn 3-10 ---b4-- -b5 -b6-
120 130 140
150
160
Chlamy.rein -
---------
DSTIEKYG
LNAVCTHLGCVVPWV
AAENK-FKCPCHGSpinacia.o
DKTLATFG
INAVCTHLGCVVPFN
AAENK-FICPCHGMastigo.lamin -
KEAIRDYG
INAVCTHLGCVVPWN
AAENK-FKCPCHGSynecho.sp ----------
DDTIANYG
ASENK-FMCPCHG
170 180 190 200 | | | | | |Chlamy.rein SQYNAEGKVVRGPAPLSLALAHCDVAESGLVTFSTWTETDFRTGLEPWWASpinacia.o SQYNNQGRVVRGPAPLSLALAHCDV DDGKVVFVPWTETDFRTGEAPWWSAMastigo.lamin SQYDETGRVIRGPAPLSLALCHATVQ DDNIVLTPWTETDFRTGEKPWWV-Synecho.sp SQYNAEGKVVRGPAPLSLALAHATVTDDDKLVLSTWTETDFRTDEDPWWABostaurus SHYDASGRIRKGPAPLNLEVPSYEFTSDDMVIVG---------------- Chicken SHYDASGRIRKGPAPYNLEVPTYQFVGDDLVVVG---------------- Sachcere SHYDISGRIRKGPAPLNLEIPAYEFDGD-KVIVG---------------- Rbsphaer SHYDSAGRIRKGPAPENLPIPLAKFIDETTIQLG---------------- Rbcapsul SHYDSAGRIRKGPAPRNLDIPVAAFVDETTIKLG---------------- -b7- -b8-- --b9- -b10--
170 180 190 200 | | | | | |Chlamy.rein SQYNAEGKVVRGPAPLSLALAHCDVAESGLVTFSTWTETDFRTGLEPWWASpinacia.o SQYNNQGRVVRGPAPLSLALAHCDV DDGKVVFVPWTETDFRTGEAPWWSAMastigo.lamin SQYDETGRVIRGPAPLSLALCHATVQ DDNIVLTPWTETDFRTGEKPWWV-Synecho.sp SQYNAEGKVVRGPAPLSLALAHATVTDDDKLVLSTWTETDFRTDEDPWWA
----------------
Chlm Spnch M.lam Sync Bos.t Chck S.cerv Rb.sp Rb.cp 25 S1 A14 -- -- -- -- -- -- -- 26 S2 K15 -- -- -- -- -- -- -- 27 R3 A16 -- -- -- -- -- -- -- 28 R4 G17 -- -- -- -- -- -- -- 29 V5 R18 -- -- -- -- -- -- -- 30 A6 V19 -- -- S1 V1 -- -- -- 31 A7 N20 -- -- H2 H2 K31 -- -- 32 P8 V21 -- -- T3 N3 S32 -- -- 33 A9 L22 -- -- D4 D4 T33 -- -- 34 K10 I23 -- -- I5 V5 Y34 -- -- 35 A11 S24 -- -- K6 T6 R35 -- -- 36 S12 K25 -- -- V7 V7 T36 -- -- 37 A13 E26 -- -- P8 P8 P37 -- -- 38 I14 R27 -- -- D9 D9 N38 -- -- 39 R15 I28 -- -- F10 F10 F39 -- -- 40 R16 R29 -- -- S11 S11 D40 -- -- 41 S17 G30 -- -- D12 A12 D41 -- -- 42 R18 M31 -- -- Y13 Y13 V42 -- -- 43 V19 K32 -- -- R14 R14 L43 -- -- 44 M20 L33 -- -- R15 R15 K44 -- -- 45 P21 T34 -- -- P16 E16 -- -- -- 46 V22 C35 -- -- E17 D17 -- -- -- 47 V23 Q36 M1 M1 V18 V18 -- -- -- 48 R24 A37 A2 T2 L19 M19 -- -- -- 49 A25 T38 Q3 Q3 D20 D20 -- -- -- Chlm Spnch M.lam Sync Bos.t Chck S.cerv Rb.sp Rb.cp 50 A26 S39 F4 I4 S21 A21 -- -- -- 51 A27 I40 T5 S5 T22 T22 -- M1 M1 52 A28 P41 E6 G6 K23 T23 -- S2 S2 53 S29 A42 S7 S7 S24 S24 -- N3 H3 54 S30 D43 M8 P8 S25 S25 E45 A4 A4 55 E31 N44 D9 D9 K26 Q26 N46 E5 E5 56 V32 V45 V10 V10 E27 T27 N47 D6 D6 57 P33 P46 P11 P11 S28 S28 D48 H7 N7 58 D34 D47 D12 D12 S29 S29 A49 A8 A8 59 M35 M48 M13 L13 E30 E30 D50 G9 G9 60 N36 Q49 G14 G14 A31 D31 K51 T10 T10 61 K37 K50 R15 R15 R32 R32 G52 R11 R11 62 R38 R51 R16 R16 K33 K33 R53 R12 R12 63 N39 E52 Q17 Q17 G34 G34 S54 D13 D13 64 I40 T53 F18 F18 F35 F35 Y55 F14 F14 65 M41 L54 M19 M19 S36 S36 A56 L15 L15 66 N42 N55 N20 N20 Y37 Y37 Y57 Y16 Y16 67 L43 L56 L21 L21 L38 L38 F58 Y17 H17 68 I44 L57 L22 L22 V39 V39 M59 A18 A18 69 L45 L58 A23 T23 T40 T40 V60 T19 T19 70 A46 L59 F24 F24 A41 A41 G61 A20 A20 71 G47 G60 G25 G25 T42 T42 A62 G21 A21 72 G48 A61 T26 T26 T43 A43 M63 A22 T22 73 A49 L62 V27 I27 T44 C44 G64 G23 G23 74 G50 S63 T28 T28 V45 V45 L65 A24 V24 75 L51 L64 G29 G29 G46 A46 L66 V25 V25 76 P52 P65 V30 V30 V47 T47 S67 A26 V26 77 I53 T66 A31 A31 A48 A48 S68 T27 T27 78 T54 G67 L32 A32 Y49 Y49 A69 G28 G28 79 T55 Y68 G33 G33 A50 A50 G70 A29 A29 80 L56 M69 A34 A34 A51 A51 A71 A30 A30 81 A57 L70 L35 L35 K52 K52 K72 -- -- 82 L58 L71 Y36 Y36 N53 N53 S73 -- -- 83 G59 P72 P37 P37 V54 V54 T74 -- -- 84 Y60 Y73 L38 A38 V55 V55 V75 V31 V31 85 G61 A74 V39 V39 S56 T56 E76 W32 W32 86 A62 S75 K40 K40 Q57 Q57 T77 P33 P33 87 F63 F76 Y41 Y41 F58 F58 F78 L34 L34 88 F64 F77 F42 L42 V59 I59 I79 I35 I35 89 V65 V78 I43 I43 S60 S60 S80 N36 N36 90 P66 P79 P44 P44 S61 S61 S81 Q37 Q37 91 P67 P80 P45 P45 M62 L62 M82 M38 M38 92 S68 G81 S46 S46 S63 S63 T83 N39 N39 93 S69 G82 G47 S47 A64 A64 A84 P40 A40 94 G70 G83 G48 G48 S65 S65 T85 S41 S41 95 G71 A84 A49 G49 A66 A66 A86 A42 A42 96 G72 G85 V50 S50 D67 D67 D87 D43 D43 97 G73 T86 G51 G51 V68 V68 V88 V44 V44 98 G74 G87 G52 G52 -- -- -- -- -- 99 G75 G88 G53 G53 L69 L69 L89 Q45 K45 100 Q76 T89 T54 V54 A70 A70 A90 A46 A46 Chlm Spnch M.lam Sync Bos.t Chck S.cerv Rb.sp Rb.cp 101 A77 I90 T55 T55 M71 L71 M91 L47 M47 102 A78 A91 A56 A56 S72 S72 A92 A48 A48 103 K79 K92 K57 K57 K73 K73 K93 S49 S49 104 D80 D93 D58 D58 I74 I74 V94 I50 I50 105 A81 A94 K59 A59 E75 E75 E95 F51 F51 106 L82 L95 L60 L60 I76 I76 V96 V52 V52 107 G83 G96 G61 G61 K77 K77 N97 D53 D53 108 N84 N97 N62 N62 L78 L78 L98 V54 V54 109 D85 D98 N63 D63 -- -- -- -- -- 110 I86 V99 V64 V64 -- -- -- -- -- 111 K87 I100 K65 K65 -- -- -- -- -- 112 A88 A101 V66 V66 -- -- -- -- -- 113 G89 A102 S67 T67 -- -- -- -- -- 114 E90 E103 K68 E68 -- -- -- -- -- 115 W91 W104 F69 F69 -- -- -- -- -- 116 L92 L105 L70 L70 -- -- -- -- -- 117 K93 K106 E71 A71 S79 S79 A99 S55 S55 118 T94 T107 S72 S72 D80 D80 A100 S56 A56 119 H95 H108 H73 H73 I81 I81 I101 V57 V57 120 L96 A109 N74 N74 P82 P82 P102 E58 E58 121 A97 P110 A75 A75 E83 E83 L103 P59 V59 122 G98 G111 G76 G76 G84 G84 G104 G60 G60 123 D99 D112 D77 D77 K85 K85 K105 V61 T61 124 R100 R113 R78 R78 N86 N86 N106 Q62 Q62 125 S101 T114 V79 V79 M87 V87 V107 L63 L63 126 L102 L115 L80 L80 A88 A88 V108 T64 T64 127 S103 T116 V81 A81 F89 F89 V109 V65 V65 128 Q104 Q117 Q82 Q82 K90 K90 K110 K66 K66 129 G105 G118 G83 G83 W91 W91 W111 F67 W67 130 L106 L119 L84 L84 -- -- -- -- -- 131 K107 K120 K85 K85 R92 R92 Q112 L68 R68 132 G108 G121 G86 G86 G93 G93 G113 G69 G69 133 D109 D122 D87 D87 K94 K94 K114 K70 K70 134 P110 P123 P88 P88 P95 P95 P115 P71 P71 135 T111 T124 T89 T89 L96 L96 V116 I72 V72 136 Y112 Y125 Y90 Y90 F97 F97 F117 F73 F73 137 L113 L126 I91 I91 V98 V98 I118 I74 I74 138 I114 V127 V92 V92 R99 R99 R119 R75 R75 139 V115 V128 V93 V93 H100 H100 H120 R76 R76 140 T116 E129 E94 Q94 R101 R101 R121 R77 R77 141 A117 S130 S95 G95 T102 T102 T122 T78 D78 142 -- -- -- -- K103 Q103 P123 E79 E79 143 -- -- -- -- K104 A104 H124 A80 K80 144 -- -- -- -- E105 E105 E125 D81 D81 145 -- -- -- -- I106 I106 I126 I82 I82 146 -- -- -- -- D107 N107 Q127 E83 E83 147 -- -- -- -- Q108 Q108 E128 L84 L84 148 -- -- -- -- E109 E109 A129 G85 A85 149 -- -- -- -- A110 A110 N130 R86 R86 Chlm Spnch M.lam Sync Bos.t Chck S.cerv Rb.sp Rb.cp 150 -- -- -- -- A111 E111 S131 S87 S87 151 -- -- -- -- V112 V112 V132 V88 V88 152 -- -- -- -- E113 D113 D133 Q89 P89 153 -- -- -- -- V114 V114 M134 L90 L90 154 -- -- -- -- S115 S115 S135 G91 G91 155 -- -- -- -- Q116 K116 A136 Q92 A92 156 -- -- -- -- L117 L117 L137 L93 L93 157 -- -- -- -- R118 R118 K138 V94 R94 158 -- -- -- -- D119 D119 D139 D95 D95 159 -- -- -- -- P120 P120 P140 T96 T96 160 -- -- -- -- -- -- -- N97 S97 161 -- -- -- -- -- -- -- A98 A98 162 -- -- -- -- -- -- -- R99 E99 163 -- -- -- -- -- -- -- N100 N100 164 -- -- -- -- -- -- -- A101 A101 165 -- -- -- -- -- -- -- N102 N102 166 -- -- -- -- -- -- -- I103 K103 167 -- -- -- -- -- -- -- D104 -- 168 -- -- -- -- -- -- -- A105 P104 169 -- -- -- -- -- -- -- G106 G105 170 -- -- -- -- -- -- -- A107 A106 171 -- -- -- -- -- -- -- E108 E107 172 -- -- -- -- Q121 Q121 Q141 A109 A108 173 -- -- -- -- H122 H122 T142 T110 T109 174 -- -- -- -- D123 D123 D143 D111 D110 175 -- -- -- -- L124 L124 A144 Q112 E111 176 -- -- -- -- E125 D125 D145 N113 N112 177 -- -- -- -- R126 R126 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